Bundibugyo ebolaviiruse puhang Kongo DV-s ja Ugandas algas kuid varem

Kesk-Aafrikas rasket haiguspuhangut põhjustanud ebolaviirus hüppas loomadelt inimesele neli kuud enne ametlikku epideemia väljakuulutamist. Varajane diagnoosimine ebaõnnestus, kuna tavapärased testid ei tuvastanud viiruse uut tüve.

Kongo Demokraatlikus Vabariigis ja Ugandas tänavu laastanud Bundibugyo ebolaviiruse puhang sai alguse juba neli kuud enne ametlikku epideemia väljakuulutamist, selgub ajakirjas Nature Medicine avaldatud uurimusest. Teadlased selgitasid välja, et viirus hüppas looduslikust reservuaarist inimesele uuesti.

Geneetiline analüüs ja ADAR-ensüüm

Placide Mbala-Kingeben ja tema juhitud rahvusvaheline töörühm analüüsisid 21 patsiendilt võetud genoomi, et selgitada välja nakkuse päritolu. Sugupuu koostamisel ilmnes, et tegemist on uue viiruseharuga, mis on geneetiliselt eraldiseisev varasematest 2007. ja 2012. aasta puhangutest. Viiruse teekonna ajastamisel kasutati inimkeha immuunvastuse jälgi. Ensüüm nimega ADAR ründab viiruse RNA-d ja jätab genoomi püsivaid mutatsioone.

Uurijad tuvastasid 25 mutatsiooni, millest üheksa olid otseselt inimkeha ensümaatilise tegevuse tulemus. Nende vigade arvukus viitab, et viirus ringles kogukonnas varjatult juba jaanuarist või veebruarist saadik. Kongo Demokraatliku Vabariigi ametivõimud kuulutasid epideemia ametlikult välja 15. mail, kuid selleks ajaks oli nakkus juba ulatuslikult levinud.

Diagnostika kitsaskohad

Haiguse varases faasis peeti sümptomeid ekslikult malaariaks või kõhutüüfuseks, kuna tavapärased kiirtestid ei suutnud patogeeni tuvastada. Viiel juhul andsid testid lausa kehtetu tulemuse. Alles sihtmärgipõhine metagenoomne järjestamine võimaldas tuvastada viiruse täieliku genoomi ja kinnitada ränga haiguspuhangu olemasolu.

Uuringu autorid rõhutavad, et epideemiatõrje vajab investeeringuid reaalajas toimivatesse diagnostikasüsteemidesse. Nende hinnangul peaks selline võimekus jõudma kaevanduspiirkondadesse ja kaugematesse küladesse, et peatada nakkusahelad nende varases staadiumis.